RNA前体选择性剪接建模与预报的任务书.docx
上传人:快乐****蜜蜂 上传时间:2024-09-14 格式:DOCX 页数:2 大小:10KB 金币:5 举报 版权申诉
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RNA前体选择性剪接建模与预报的任务书任务目标:使用机器学习方法,对RNA前体在选择性剪接过程中出现的剪接事件进行建模和预报,探索RNA选择性剪接的机理和规律,并提高RNA剪接元件识别准确率。任务内容:1.收集RNA前体选择性剪接事件数据,包括基因组序列、剪接位置和剪接区间等信息。2.建立RNA选择性剪接事件的分类模型,探索RNA剪接元件的作用;优化特征表示,探索适当的机器学习算法。3.针对剪接事件的分类模型,设计合理的评价指标和实验验证方法,评价模型的性能。4.对对剪接元件的预测模型进行实际应用,验证模型的实用性。5.撰写本任务的完整报告。任务分工:1.数据收集:A、B;2.模型建立:C、D;3.实验验证:E;4.报告撰写:全部。任务要求:•至少使用一种机器学习算法(如神经网络、支持向量机、决策树等),探索包括特征提取、特征表示和模型优化在内的关键问题;•设计至少两个实验,运用不同方法对任务进行实验验证,综合分析模型优劣;•撰写完整的论文报告,包括任务背景、研究方法、实验设计、结果分析和结论。参考文献:1.XiongHY,AlipanahiB,LeeLJ,etal.RNAsplicing.Thehumansplicingcoderevealsnewinsightsintothegeneticdeterminantsofdisease.Science,2015,347(6218):1254806.2.YangX,Coulombe-HuntingtonJ,KangS,etal.WidespreadExpansionofProteinInteractionCapabilitiesbyAlternativeSplicing.Cell,2016,164(4):805-817.3.WangGS,CooperTA.SplicinginDisease:DisruptionoftheSplicingCodeandtheDecodingMachinery.NatRevGenet,2017,18(12):749-771.