利用mRNA差异显示技术对苏淮白猪肌内脂肪沉积相关调控基因的分析的中期报告.docx
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利用mRNA差异显示技术对苏淮白猪肌内脂肪沉积相关调控基因的分析的中期报告.docx

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利用mRNA差异显示技术对苏淮白猪肌内脂肪沉积相关调控基因的分析的中期报告本次研究旨在利用mRNA差异显示技术对苏淮白猪肌内脂肪沉积相关调控基因进行分析。研究在6头苏淮白猪身上进行,每头猪的长肌和肩胛肌分别取样,分别作为实验组和对照组。实验组猪在饲喂时加入高脂饲料,对照组猪饲喂普通饲料。两组猪分别饲养4周,然后进行样品采集和处理。样品处理主要包括RNA提取、减少污染DNA的处理、cDNA合成等步骤。提取出的RNA通过Agilent2100生物分析仪对RNA进行质量检测,并筛选出质量合格的RNA进行下一步分析。接下来根据TruSeqRNASamplePreparationKit的说明书进行文库制备,建立实验组和对照组各自的文库。序列测序通过IlluminaHiSeq2000平台进行。数据处理主要包括去除低质量序列、除去linker序列、删除接头和过滤低质量reads等步骤。通过Bowtie2软件比对至猪基因组参考序列,利用RSEM软件计算每个基因的表达水平。初步结果表明,实验组和对照组肌内脂肪沉积相关基因上下调表达情况不同。进一步分析这些基因的功能,预计有助于揭示肌内脂肪沉积的分子调控机制。下一步将进行基因差异表达的验证和分析。
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