出生前后仔猪肺脏组织的转录组分析和lncRNA鉴定的任务书.docx
上传人:快乐****蜜蜂 上传时间:2024-09-15 格式:DOCX 页数:3 大小:11KB 金币:5 举报 版权申诉
预览加载中,请您耐心等待几秒...

出生前后仔猪肺脏组织的转录组分析和lncRNA鉴定的任务书.docx

出生前后仔猪肺脏组织的转录组分析和lncRNA鉴定的任务书.docx

预览

在线预览结束,喜欢就下载吧,查找使用更方便

5 金币

下载此文档

如果您无法下载资料,请参考说明:

1、部分资料下载需要金币,请确保您的账户上有足够的金币

2、已购买过的文档,再次下载不重复扣费

3、资料包下载后请先用软件解压,在使用对应软件打开

出生前后仔猪肺脏组织的转录组分析和lncRNA鉴定的任务书任务书任务概述:本任务旨在对出生前后仔猪肺脏组织的转录组进行分析,并鉴定其中的lncRNA,以探究仔猪胚胎时期肺脏发育的分子调控机制和可能的新型调控因子。任务内容:1.出生前后仔猪肺脏组织RNA提取,RNA质量评估和RNA测序2.RNA序列比对成基因定位和定量,差异表达基因分析3.进行GO/KEGG功能分类和通路富集分析4.鉴定差异表达的lncRNA序列,注释其生物信息,筛选优势lncRNA进行验证5.结果展示和解读,撰写任务报告任务要求:1.确定RNA提取的方法,保证获得高质量RNA样品2.选择高通量测序平台进行RNA测序,并对数据进行严格质控和过滤,保证数据的可靠性和准确性3.使用合适的比对软件和数据库对RNA序列进行比对和定量,构建基因表达谱4.借助GeneOntology数据库和KEGG通路数据库进行GO/KEGG功能分类和通路富集分析5.使用合适的软件和算法对差异表达lncRNA进行鉴定并进行注释,筛选出优势lncRNA序列进行验证6.结果必须进行严格的验证和统计学分析,确保可重复性和统计学显著性7.任务报告写作需要结合实验数据,逐一解读和解释实验结果,同时提供适当的图片或图表,让读者更加清晰地理解实验设计、方法和结果。任务分工:1.RNA提取:软件工程师2.RNA测序和数据分析:生物信息学家3.差异表达分析:统计学家4.lncRNA鉴定和验证:生物学家5.任务报告撰写:数学与生物学专业的成员任务时间:本任务周期为一个月。其中,RNA提取和测序需要1周时间,数据分析和差异表达分析需2周时间,lncRNA鉴定和验证需要1周时间,报告撰写需要1周时间。任务产出:任务完成后,将获得如下产出物:1.RNA测序质控报告2.基因表达谱和差异表达谱3.GO/KEGG分析结果报告4.lncRNA鉴定和验证结果报告5.最终任务报告参考文献:1.Wu,C.,etal.(2018).IdentificationandcharacterizationoflongnoncodingRNAsrelatedtothedevelopmentalstagesofporcinefemalegermcells.BMCGenomics19,953.2.Li,Y.,etal.(2018).TranscriptomeProfilingofLungTissuefromPigsInfectedwithH1N1SwineInfluenzaVirusbyHigh-ThroughputSequencing.Viruses10,729.3.Wang,Z.,etal.(2021).IntegratedanalysisoflncRNAandmRNAprofilesrevealsthepotentialrolesoflncRNAinregulatingtheprocessofacuterejectioninpig-to-humanlivertransplantation.AMBExpress11,63.
立即下载