加权蛋白质折叠构象网络的拓扑特征研究的中期报告本次研究旨在探究加权蛋白质折叠构象网络（WeightedProteinFoldingConformationNetwork,WPFCN）的拓扑特征。WPFCN是一种基于蛋白质折叠能量图谱，采用加权邻接矩阵构建的网络模型，能够反映蛋白质折叠的动态过程。在研究过程中，我们首先从PDB数据库中随机选取了100个蛋白质样本，对其进行了分子动力学模拟，得到了每个时刻的构象信息。然后，我们利用Rosetta软件计算了每个构象的折叠能量，并根据一定的阈值将构象间的连接表示为加权邻接矩阵。最后，我们采用图论和复杂网络分析的方法，研究了WPFCN的拓扑特征。目前的研究结果显示，WPFCN呈现出典型的小世界网络特征，即呈现短平均路径和高聚集度的特征。另外，我们还发现WPFCN的度分布呈现幂律分布，表明网络中存在少量的高度连通的节点。此外，我们正在进一步研究WPFCN中的节点中心性、社区结构等复杂网络特征，并将结合蛋白质折叠过程的动态特征，对WPFCN的拓扑特征进行深入分析和探究。总之，本次研究对于探讨蛋白质折叠过程中的网络特征具有一定的意义，并有望为深入理解蛋白质折叠机制提供新的视角和思路。