利用B细胞抗体类别转换模型进行A-EJ修复通路的研究的开题报告.docx
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利用B细胞抗体类别转换模型进行A-EJ修复通路的研究的开题报告开题报告题目:利用B细胞抗体类别转换模型进行A-EJ修复通路的研究引言:DNA双链断裂(DSB)是生物体内最为致命的一种DNA损伤。如果不及时和正确地修复,会导致致命的细胞死亡或不稳定性基因组变异,进而促进人类染色体异常相关疾病,如肿瘤。DNA修复通路对于细胞自身生存和遗传稳定至关重要。因此,DNA修复通路及其调控机制一直是癌症治疗和预防的重要研究方向。在这些修复途径中,替代末端结合途径(A-EJ)是一种常见且重要的DNA双链断裂修复方式,它主要介导修复体系通过随机粘合和酶促野生型基因座的修复。近年来,随着单细胞转录组学和单细胞蛋白组学等高通量分析技术的快速发展,揭示B细胞抗体类别转换(CSR)重组过程和A-EJ修复通路发生的生化反应机制,是研究抗体多样性及其调节机制、抗体病理生理学、DNA修复及其调控机制等领域的重要问题。综合已有文献报道,B细胞抗体类别转换模型是一种非常有效的CSIDNA双链断裂修复途径,它涉及多个协同作用因子。近年来有不少研究表明,抗体类别转换因子在A-EJ修复途径中发挥着同样的作用,尤其是在修复过程中的粘附和DNA末端处理过程中发挥了重要作用。基于以上背景,本研究拟利用B细胞抗体类别转换模型进行A-EJ修复通路的研究,分析其生化反应过程、机制和影响因素,进一步深入探讨抗体类别转换因子在DNA修复途径中的作用机制,有望为DNA修复调节疾病治疗提供新的治疗策略。研究内容和方法:1.构建B细胞抗体类别转换模型利用基因工程技术,构建B细胞抗体类别转换模型。实验中将使用大鼠B细胞或小鼠B细胞,将其分化为记忆B细胞或浆细胞。利用多发性转录起始子、排斥序列和多剪切选择位点等方式,产生特定的抗体类别转换,旨在构建B细胞抗体类别转换模型,并定量检测转换效率和效果。2.体外模拟A-EJ修复反应过程在模型构建过程中,分别添加WT抗体和抗体类别转换因子,反应温度为37°C-62°C分为3个时间段,分别培养12、24、36h。采用DNA双链断裂状态,体外模拟A-EJ修复反应过程。并使用半定量PCR方案,确定每个基因在试验条件下的相对mRNA含量。3.采集细胞样本取B细胞系列细胞、正常细胞和肿瘤细胞,在每组分别添加A-EJ修复因子诱导DNA双链断裂,然后在不同的时间点收集舒适贴管和黏附细胞进行分析。4.RT-qPCR和蛋白免疫印迹采用RT-qPCR技术和蛋白免疫印迹技术,检测不同处理组癌细胞和正常细胞中相关基因mRNA的表达和蛋白的表达水平。预期结果:预期结果该研究对A-EJ修复通路和B细胞抗体类别转换的分子机制和调控提供了深入探究。通过这项研究将有助于深入理解DNA修复通路的相关生物化学和分子生物学机制,并为癌症的治疗提供新的理论和治疗策略。参考文献:1.SykoraP,WilsonDM3rd,BohrVA.DNAdamageandrepairinAlzheimer'sdisease:currentknowledgeandfuturedirections.FutureNeurol.2013;8(2):187-206.2.KetleyJN,AllanJM.ThetherapeuticpotentialofDNArepairpathwaysincancer.FutureOncol.2013;9(6):831-43.3.StricklandKC,HowieHL,FazzariMJ,etal.Replicationstressinduces53BP1-containingOPTdomainsinG1cells.JCellSci.2012;125(Pt20):4969-81.
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