内容一、生物信息学的概念（p199）人基因组海量信息23对=46条染色体30亿碱基对(basepairs)3～5万个基因基因组学3万种以上蛋白质蛋白质组学基因表达、作用、调控网络已经或即将完成的生物全基因组后基因组时代的到来人类首次了解了自身的基因序列，了解了很多远亲生物的基因序列正在面对指数扩增的基因序列和各种数据库面临如何将基因序列资料转变为有用的知识，进而服务于人类，造福人类健康的挑战人类功能基因组学必须多学科协作生物信息学技术生物芯片技术蛋白质组学技术高通量细胞筛选技术等生物信息学是人类功能基因组学研究的必要工具生物信息的开发和应用1.基因与基因组分析基因预测特定状态碱基对的概率取决于它前面碱基对的状态向另一种状态的转换概率取决于转换信号的出现(剪切位点)和/或在特定隐藏状态的碱基对平均数量(即内含子或外显子大小).研究主要集中在核苷酸序列的存储、分类、检索和分析等方面新基因的发现非蛋白编码区生物学意义的分析基因组整体功能及其调节网络的系统把握基因组演化与物种演化蛋白质结构新蛋白的完整、精确和动态的三维结构计算机辅助结构模拟理解蛋白质的氨基酸序列和三维结构之间的关系蛋白质序列及特性分析蛋白质组学三、生物信息学的研究方法和技术数据库技术生物分子信息的存储、管理、查询等功能建立在数据库管理系统之上人工神经网络技术在功能上、结构上模拟大脑神经网络神经网络计算速度快，更具有分析智能应用：神经网络计算在优化和模式识别方面具有非常强的能力基因识别、蛋白质结构预测上神经网络都取得了比其它方法更为准确的结果分子模型化技术利用计算机分析分子结构。通过交互操作平移、旋转和缩放分子的三维结构，从不同的角度观察分子构象和形状分子力学和量子力学计算主要基于半经验势函数的分子力学方法研究生物大分子的构象量子力学在确定势函数的参数和研究局部性质分子动力学模拟研究蛋白质的构象及动力学，是计算机模拟实验的基础“HalfdayontheWeb，savesyouhalfmonthinthelab”国外一直非常重视生物信息学的发展，各种专业研究机构和公司如雨后春笋般涌现出来，生物科技公司和制药工业内部的生物信息学部门的数量也与日俱增1979年，美国洛斯阿拉莫斯国家实验室建立起GenBank数据库；1982年，欧洲分子生物学实验室提供核酸序列数据库EMBL的服务；1984年，日本着手建立国家级的核酸序列数据库DDBJ并于1987年开始提供服务国内对生物信息学领域也越来越重视1997年3月，北京大学于成立了生物信息学中心；2000年3月，中科院上海生命科学研究院成立其他，北京大学的罗静初和顾孝诚教授在生物信息学网站建设方面、中科院生物物理所的陈润生研究员在EST序列拼接方面以及在基因组演化方面、天津大学的张春霆院士在DNA序列的几何学分析方面等等……基因图谱数据库核酸序列数据库蛋白质序列数据库大分子结构数据库等国际著名的生物信息中心NCBINationalCenterforBiotechnologyInformation(US)EBIEuropeanBioinformaticsInstitute(EU)HGMPHumanGenomeMappingProjectResourceCentre(UK)ExPASyExpertofProteinAnalysisSystem(Switzerland)CMBICentreofMolecularandBiomolecule(TheNetherlands)ANGISNationalGenomeInformationService(Australia)NIGNationalInstituteofGenetics(Japan)BICNationalBioinformaticsCentre(Singapore)国内部分生物信息学和生物医学信息服务器北京大学生物信息中心http://www.cbi.pku.edu.cn中国生物信息http://www.biosino.org/北京大学物理化学研究所http://www.ipc.pku.edu.cn北京医科大学生物医学信息http://cmbi.bjmu.edu.cn中国科学院微生物研究所http://www.im.ac.cn天津大学生物信息中心http://tubic.tju.edu.cn中科院计算所智能信息处理重点实验室生物信息学研究组http://www.bioinfo.org.cn/中国科学院基因组信息学中心http://www.genomics.org.cn/DNA数据库GenBank的增长资料来自：http://www.ddbj.nig.ac