肾脏纤维化大鼠模型尿液及肾脏组织差异表达基因筛选及信息学分析的任务书任务书任务概述：本次任务旨在构建肾脏纤维化大鼠模型，采集其尿液及肾脏组织样本，利用基因芯片技术筛选差异表达基因，并进行信息学分析，探究肾脏纤维化的分子机制。任务内容：1.制备大鼠肾脏纤维化模型：选择适宜的方法（如大鼠单侧肾动脉夹闭、大鼠双肾缺血再灌注等），给予大鼠适宜的干扰（如肾毒性药物、高磷饮食、高脂饮食等），在模型制备后随机分组，同时给予对照组。2.采集尿液及肾脏组织样本：在模型构建成功后，对实验大鼠进行各项指标监测、尿液采集等，采集对照组与模型组的尿液及肾脏组织样本，分别保存于低温（-80℃）储存箱与石蜡包埋箱。3.基因芯片技术筛选差异表达基因：对于收集到的尿液及肾脏组织样本进行基因芯片测序分析，将基因表达量标准化，并计算不同组间的差异值，获得差异表达基因，其中p值及q值均要统计并比较。4.信息学分析：对所筛选到的差异表达基因进行生物信息学分析，包括富集分析（如基因本体、KEGG通路等）、蛋白质交互作用网络分析等等。任务要求：1.模型制备方法得到论证，可行性得到验证；2.采集到的样本保存完好、准确可靠；3.差异表达基因筛选结果可靠，筛选出的基因组成合理；4.信息学分析结果具有生物学意义，能够解释实验结果，为研究提供启示。任务期限：本任务周期为三个月，其中模型制备及尿液、肾脏组织样本采集为第一阶段，基因芯片测序分析为第二阶段，信息学分析为第三阶段，每个阶段工作量大概分配为1/3，允许不同阶段之间适当调整工作进度。提交物及评价标准：1.模型构建成功的验证图表以及采集标本的处理方法：评价标准为得到的图表科学可靠、处理方法可行；2.差异表达基因筛选结果及相关统计表格：评价标准为基因筛选结果可靠，筛选过程详细准确；3.信息学分析结果表格或图表及相关解释：评价标准为分析结果合理可靠，对筛选基因作出详细解释。任务所需技能：1.大鼠模型构建经验；2.生物样本采集、保存、处理技能；3.生物芯片技术及基因表达数据分析技能；4.生物信息学分析技能；5.报告撰写和表达良好的汇报能力。参考文献：1.ZhangH,QianM,ZhaoX,etal.Masreceptormediatesrenalfibrosisinchronicrestraintstress-inducedhypertensiverats[J].Americanjournalofphysiology.Renalphysiology,2018,315(6):F1866-F1877.2.HeymanSN,ArzooK,EpsteinFH,etal.Earlyrenalischemia,withorwithoutreperfusion,causesangiotensinII-dependentvasculargenerationofTGF-beta1andfunctionalkidneydamage[J].Americanjournalofphysiology.Renalphysiology,2005,288(4):F830-F837.3.KongY,WangY,JiangJ,etal.Silentinformationregulator1protectsagainstdiabetickidneydiseasethroughamelioratingglomerularendothelialdysfunction[J].Kidneyinternational,2018,94(6):1131-1144.