单细胞全基因组扩增联合比较基因组杂交方法的建立及初步研究的任务书.docx
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单细胞全基因组扩增联合比较基因组杂交方法的建立及初步研究的任务书任务名称:单细胞全基因组扩增联合比较基因组杂交方法的建立及初步研究任务背景:目前在个性化医学和癌症分子诊断中,单细胞测序等单细胞技术的广泛应用已经成为一种趋势。但是由于单细胞样本数量十分有限,DNA提取量不足,难以进行传统的全基因组测序和全基因组比较等实验研究,因此需要开发一种新的方法来解决以上问题。任务目的:本任务旨在建立一种单细胞全基因组扩增联合比较基因组杂交方法,实现在单个细胞水平上,对全基因组进行全面测序和差异分析,为精准医疗和癌症研究提供技术支持。任务内容:1.设计单细胞全基因组扩增实验方案,包括单细胞的收集和分离、DNA的提取与扩增等步骤。2.建立全基因组杂交实验方案,包括差异样本DNA的制备、探针的设计与合成、实验操作流程等步骤。3.对已建立的全基因组扩增与比较基因组杂交方法进行优化,优化方案包括扩增反应条件的调整、探针浓度的优化、标记体系的改进等。4.应用所建立的方法对几种常见肿瘤细胞和正常细胞进行全基因组比较,探索其中的差异基因和相关生物学机制。5.撰写研究报告并发表论文,介绍所建立的方法的优越性和应用价值。参考资料:1.ShangQ,YangZ,JiaW,etal.Single-cellRNA-seqandATAC-seqanalysisofcardiacprogenitorcelltransitionstatesandlineagesettlement.NatureCommunications,2020,11(1):3955.2.HeZ,WangX,FuS,etal.Whole-genomeanalysisofsingle-cellgeneexpressionusingDROP-seqandREAP-seqinembryonicstemcells.BMCGenomics,2019,20(1):565.3.HouY,GuoH,CaoC,etal.Single-celltripleomicssequencingrevealsgenetic,epigenetic,andtranscriptomicheterogeneityinhepatocellularcarcinomas.CellResearch,2016,26(3):304-319.