Fank1基因敲减小鼠差异表达基因筛选及验证的中期报告本实验旨在通过Fank1基因敲减小鼠RNA测序数据的分析，筛选出与Fank1基因敲减相关的差异表达基因，并对一部分基因进行验证。本次报告为中期报告，主要介绍了样本的RNA测序数据分析和差异表达基因的筛选结果。实验方法：-采用shRNA干扰技术构建Fank1基因敲减小鼠模型；-收集小鼠脑组织，提取总RNA，进行RNA测序；-对测序数据进行质控与过滤，去除低质量序列和接头序列，得到干净的测序数据；-利用Hisat2和StringTie软件分析样本的基因表达量和差异表达基因；-利用R软件对差异表达基因进行生物信息学分析，包括通路富集分析、GO富集分析等；-在筛选出的差异表达基因中，选取一部分基因进行RT-qPCR验证。初步结果：经过测序数据的过滤和比对，我们得到了35760个基因的表达量信息。利用DESeq2软件对样本进行差异表达基因分析，筛选出了1955个显著差异表达基因，其中上调基因886个，下调基因1069个。进行通路富集分析和GO富集分析，发现差异表达基因主要涉及到细胞信号传导、神经发育、细胞周期等生物学过程。根据筛选结果，我们选取了20个差异表达基因进行RT-qPCR验证，预计在下一阶段得到验证结果。结论：本实验分析了Fank1基因敲减小鼠的RNA测序数据，从中筛选出了明显的差异表达基因，并对这些基因进行了生物信息学分析。进一步的实验将从筛选出的基因中选择一部分进行验证，以更深入地探究Fank1基因敲减对小鼠神经系统的影响。