RNA二级结构在果蝇Dscam基因外显子4和6互斥可变剪接中的作用研究的开题报告题目RNA二级结构在果蝇Dscam基因外显子4和6互斥可变剪接中的作用研究背景Drosophilamelanogaster（果蝇）中的downsyndromecelladhesionmolecule（Dscam）基因可变剪接有38,016种不同的转录本，这种可变剪接模式那在Dscam的三个互补决定区（Ig，Fn3，和TM）。其中，在外显子4和外显子6之间出现互斥可变剪接。外显子4包含3个可变外显子，外显子6包含12个可变外显子。因此，这种互斥在Dscam基因中可产生多达1,584个不同的Dscam蛋白质变体。前人的研究表明，Dscam基因的RNA二级结构在可变剪接中起重要作用。RNA二级结构能够通过影响外显子的剪接位点或物理阻碍剪接因子的结合来影响可变剪接。此外，也有研究表明，RNA二级结构可以通过与RNA结合蛋白相互作用来调节可变剪接。因此，本研究将探讨RNA二级结构在果蝇Dscam基因外显子4和6互斥可变剪接中的作用。目的本研究的主要目的是探讨RNA二级结构在果蝇Dscam基因外显子4和6互斥可变剪接中的作用。具体包括以下几个方面：1.分析RNA二级结构对Dscam外显子4和6互斥可变剪接的影响。2.研究RNA结合蛋白在Dscam外显子4和6互斥可变剪接中的作用。3.探究DscamRNA二级结构和RNA结合蛋白的相互作用机制。方法1.RNA结构预测：使用RNAfold工具预测Dscam基因外显子4和6的RNA二级结构。2.RNA剪接分析：使用RT-PCR和Westernblot分析Dscam基因互斥可变剪接的变化。3.RNA结合蛋白分析：使用RNApull-down实验、RNAimmunoprecipitation和Westernblot等方法分析Dscam外显子4和6的RNA结合蛋白。4.RNA结构和RNA结合蛋白相互作用分析：使用RNAelectromobilityshiftassay（EMSA）和cross-linkingassay等方法分析DscamRNA二级结构和RNA结合蛋白之间的相互作用。预期结果1.RNA二级结构会影响Dscam基因外显子4和6的可变剪接，并且在不同可变剪接事件中产生不同程度的影响。2.RNA结合蛋白与DscamRNA二级结构交互，对可变剪接的选择性起重要作用。3.探明DscamRNA二级结构和RNA结合蛋白之间的相互作用机制，探讨其调节可变剪接的机制。意义1.对可变剪接的调控机制提供新的思路和方向。2.为了解Dscam基因可变剪接模式的形成机制提供重要的研究基础。3.对未来RNA二级结构在可变剪接调控中的应用提供一定的理论依据。