提灯藓科DNA条形码的筛选的任务书.docx
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提灯藓科DNA条形码的筛选的任务书任务书:提灯藓科DNA条形码的筛选一、任务背景提灯藓科是地衣藓类植物中的一个重要科,其具有稳定、复杂的菌体结构和多样的生物活性物质,被广泛应用于医药、保健、化工及环保等行业。随着基因组学、生物信息学、大数据等技术的发展,利用分子遗传学的方法为提灯藓科植物建立起DNA条形码库,越来越受到人们的关注。二、任务目标本次任务的主要目标是应用基因组学的技术,利用DNA条形码方法,筛选出一组可靠性高的提灯藓科植物样品,为建立提灯藓科DNA条形码库奠定基础。三、任务内容(一)样品收集本次任务对提灯藓科植物样品的收集应通过科学、规范、公正的方式进行。样品的来源应该满足以下要求:1.具有代表性2.植物物种信息的完整性和准确性3.样品的存储条件符合生物学样品的保存标准要求4.样品来源清晰可查(二)DNA提取1.样品处理:样品交于样品管理人员进行样品整理,同时拍摄样品选取前后的照片以供后续审核。将样品进行冻干、制片等预处理。2.DNA提取:采用现有的基因提取试剂盒进行DNA提取,包括植物DNA提取试剂盒和基于硅胶柱层析技术的DNA提取试剂盒。按照说明书操作。(三)PCR扩增对提灯藓科植物的选取出的核心区域进行PCR扩增,使用现有的宏基因组PCR方法进行扩增。主要操作包括:1.核心区域选择2.引物设计3.PCR扩增4.反应体系调整(四)DNA测序PCR扩增反应后的产物通过已有的测序服务进行测序,包括Sanger测序和二代测序等。注意进行质量审核和数据清洗。(五)数据分析1.序列比对2.模式识别3.系统发生树构建四、任务要求1.样品选择范围:提灯藓科植物样品2.数据质量标准:DNA提取后,PCR扩增后的反应产物要求测序,所得到的序列质量需要符合系统发生学数据的质量标准。3.时间要求:整个任务周期为一个月,包括样品收集、DNA提取、PCR扩增、DNA测序和数据分析等环节。五、任务成果本次任务成功完成后,需要返回一组满足DNA条形码要求的提灯藓科植物样品图谱。主要成果包括:1.样品选取证明2.样品核心区域PCR扩出产品3.测序数据质量报告4.数据分析报告,包括模式识别、系统发生树等内容。六、其他要求本次任务执行过程中需要高度重视样品信息的披露,遵循遗传数据的安全等相关要求。同时,应十分关注样本生物多样性论文发布、相关专著编撰等目标,以便更好地推进提灯藓科植物研究领域的发展。