c-Abl调节可变剪接及无义突变介导的mRNA降解的开题报告一、研究背景可变剪接是一种常见的RNA后转录修饰过程，能够通过不同组合的外显子互相剪接产生多种不同的mRNA转录本。可变剪接在维持正常基因表达水平以及调节不同细胞状态下的基因表达中发挥着极为重要的作用。但是，可变剪接也会导致产生含有无义突变的mRNA转录本，这些mRNA转录本可能会被快速降解。c-Abl是一种酪氨酸激酶，与多个信号通路和细胞生物学过程密切相关。近年来的研究表明，c-Abl还能够通过调节RNA处理和降解过程，参与调节基因表达。具体而言，c-Abl除了在转录后调节mRNA的转运中发挥作用外，还能够直接磷酸化RNA结合蛋白，并影响可变剪接、RNA剪切和mRNA降解等过程。二、研究目的本研究旨在探究c-Abl对可变剪接和无义突变介导的mRNA降解的调控机制。具体研究内容包括：1.利用RNA测序技术分析c-Abl调节的可变剪接转录本的差异表达。2.利用实时荧光定量PCR和Westernblot等技术验证差异表达的可变剪接转录本的表达差异，并验证c-Abl对可变剪接的影响。3.利用荧光素酶报告基因系统验证c-Abl对无义突变介导的mRNA降解的影响。4.利用蛋白质组学技术鉴定c-Abl作用于RNA处理和降解过程的靶蛋白。三、研究意义1.通过深入探究c-Abl在可变剪接和无义突变介导的mRNA降解中的作用机制，有望揭示新的RNA处理和降解调控机制，为RNA生物学领域研究提供新的思路和手段。2.对于c-Abl在疾病发生发展过程中的作用，疾病管理和治疗提供新的靶点和策略，能够对癌症、自身免疫性疾病等疾病的预防和治疗提供新的理论和实践依据。3.为理解可变剪接和无义突变的生物学意义以及RNA后转录修饰的调节机制提供新的视角和思路，促进RNA后转录修饰领域的研究和发展。四、研究方法本研究将应用RNA测序技术、实时荧光定量PCR、Westernblot分析、荧光素酶报告基因系统、蛋白质组学技术等多种方法和技术。1.RNA测序技术：对c-Abl过表达、抑制或靶向敲除细胞系中可变剪接的mRNA进行RNA测序，分析差异表达基因，确定c-Abl调节的可变剪接转录本。2.实时荧光定量PCR和Westernblot分析：验证差异表达的可变剪接转录本的表达差异，验证c-Abl对可变剪接的影响，同时检测与c-Abl相关的蛋白表达差异。3.荧光素酶报告基因系统：构建c-Abl对无义突变介导的mRNA降解的影响的荧光素酶报告基因系统，验证c-Abl对无义突变介导的mRNA降解的影响。4.蛋白质组学技术：应用蛋白质组学技术对c-Abl作用于RNA处理和降解过程的靶蛋白进行鉴定和筛选，深入探究c-Abl在RNA处理和降解过程中的作用机制。