三叶草属三种植物遗传多样性的RAPD分析的中期报告.docx
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三叶草属三种植物遗传多样性的RAPD分析的中期报告本研究旨在利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对三叶草属三种不同植物的遗传多样性进行分析。三种植物分别为TrifoliumrepensL.(白车轴草)、TrifoliumpratenseL.(紫苜蓿)和TrifoliumincarnatumL.(赤苜蓿)。本研究的中期报告如下:1.样本收集与DNA提取共采集了来自不同地区的30个三叶草属植物样本,其中每种植物各10个。样本的新鲜叶片组织经过冰冻保存和粉碎后,采用CTAB法提取总DNA,并通过琼脂糖凝胶电泳进行DNA的纯化和分离。2.RAPD扩增反应条件的优化通过对PCR电容量、扩增温度、Mg2+浓度、引物浓度等PCR反应条件的优化,最终确定了适宜的反应体系为:25μlPCR反应体系含有2.5μl10×PCR缓冲液,1.5mmol/L的Mg2+,0.1mmol/L的dNTPs,0.2μmol/L的引物,2.5UTaqDNA聚合酶和100ng的DNA模板。3.RAPD扩增反应的结果分析在本研究中,我们使用了10对引物进行了RAPD扩增反应,产生了明显的多少多态性DNA条带。通过对不同植物的RAPD衍生成果的比较,我们发现:a)不同引物扩增产生的DNA条带数目不同;b)不同植物之间的RAPD扩增结果差异显著;c)同一种植物内不同个体之间的RAPD扩增结果差异也显著。4.遗传多样性分析通过对不同引物扩增结果的分析,我们计算了Shannon多样性指数和Nei基因多样性指数,并绘制了聚类图和主坐标图。结果显示三种植物内部遗传多样性较高,不同植物之间的遗传差异显著。综上,本研究初步分析了三叶草属三种植物的RAPD扩增反应结果,并在此基础上计算了遗传多样性指数,结果表明三种植物内部遗传多样性丰富,不同物种之间的遗传差异较大。下一步,我们将扩大样本量和引物筛选,进一步研究三叶草属植物的遗传多样性和遗传进化。