中华雏蝗和日本鸣蝗全线粒体基因组的测序及分析的任务书.docx
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中华雏蝗和日本鸣蝗全线粒体基因组的测序及分析的任务书任务名称:中华雏蝗和日本鸣蝗全线粒体基因组的测序及分析任务目的:1.对中华雏蝗和日本鸣蝗进行全线粒体基因组测序,获取其基因组序列信息;2.对测序数据进行分析,包括基因组结构、基因注释、基因多样性、进化关系等方面的内容;3.探究中华雏蝗和日本鸣蝗之间的遗传差异,提供相关基因组学信息为其生态学和遗传研究提供参考。任务内容:1.提取中华雏蝗和日本鸣蝗的基因组DNA,进行测序;2.利用IlluminaHiSeq平台进行测序,生成长约150bp的双端测序数据;3.对测序数据进行质控、过滤和组装等预处理步骤,获取两个物种的完整线粒体基因组序列;4.对比分析中华雏蝗和日本鸣蝗的线粒体基因组序列,注释其基因、基因间区域、tRNA、rRNA,构建基因组结构图;5.利用公共数据库比对两种线粒体基因组序列,探究两种物种的进化关系、遗传多样性和种群分化等问题;6.结合基因组结构、进化分析、遗传群体等多方面信息,对中华雏蝗和日本鸣蝗的生态属性、遗传特征等方面进行讨论。任务进度:1.提取样品DNA、进行测序预处理:1周2.测序、数据质控、组装等步骤:3周3.基因注释、基因组结构、进化分析等步骤:2周4.数据分析和结果讨论:2周任务交付:1.中华雏蝗和日本鸣蝗全线粒体基因组序列数据;2.两种线粒体基因组的组装图、基因注释、进化关系分析结果;3.数据分析报告和结果讨论稿件。