KAP-1复合体参与β-珠蛋白基因座基因表达调控的分子机制研究的中期报告.docx
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KAP-1复合体参与β-珠蛋白基因座基因表达调控的分子机制研究的中期报告研究背景和意义:β-珠蛋白基因座包含了多个β-珠蛋白基因,这些基因编码了组成细胞血红蛋白的重要组分之一。β-珠蛋白基因座显著与遗传性贫血等疾病相关,因此对其基因表达调控机制的研究具有重要意义。先前研究发现,KAP-1复合体可以调控某些基因的表达,但其是否参与了β-珠蛋白基因座的表达调控还不清楚,因此需要进一步探究其分子机制。研究内容和方法:本研究使用CRISPR/Cas9技术构建KAP-1knockdownHEK293T细胞系,通过RNA-seq技术对KAP-1knockdown和对照细胞系的基因表达进行比较分析,筛选出与KAP-1knockdown显著相关的差异表达基因。进一步利用实时荧光定量PCR和西方印迹等技术对不同基因在KAP-1knockdown和对照细胞系中的表达水平进行验证,并在整个β-珠蛋白基因座中寻找KAP-1和其调控的基因的靶点。最后,将鉴定功能的靶点进一步用CHIP-qPCR技术确认其在不同组织中的表达水平。研究进展和预期结果:初步结果表明,KAP-1knockdown能够显著影响多个β-珠蛋白基因的表达,包括HBB、HBD、HBE1等,同时还发现KAP-1knockdown会影响其他基因的表达,如MYH11、LGR5等。进一步分析发现,KAP-1可能通过改变某些DNA结合因子的共同作用来影响上述基因的表达。预计本研究将深入阐明KAP-1复合体参与β-珠蛋白基因座基因表达调控的分子机制,为相关疾病的发病机制提供新的思路和目标。
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