基于ABEEMσπ模型能量求解并行处理的研究的任务书.docx
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基于ABEEMσπ模型能量求解并行处理的研究的任务书任务书1.研究背景随着分子模拟技术的发展,基于分子力学方法的能量求解已成为研究物质结构和性质的重要手段之一。然而,对于大尺寸的蛋白质分子和生物大分子体系能量的计算需求十分庞大,传统的串行计算方法不能满足实际需求。因此,开展基于分子力学方法的并行化计算方案研究,提升其处理能力,具有重要的意义。2.研究目的本研究旨在研究基于ABEEMσπ模型能量求解并行处理的方案,通过并行化算法和并行计算平台的应用,提升能量求解的效率和精度,为研究大尺寸的蛋白质分子和生物大分子体系提供支持。3.研究内容(1)分析ABEEMσπ模型的计算过程和能量项。(2)探索并行化算法的实现方案。(3)开发并行计算平台,并进行不同规模数据的并行计算测试。(4)评估并行化计算方案的效率和精度,并进行对比分析。4.研究方法(1)文献调研法:对ABEEMσπ模型的发展历程和理论基础进行深入调研,明确其计算过程和能量项,为后续并行化算法实现提供理论依据。(2)算法设计法:根据并行计算的需求,探索并行化算法实现方案,设计有效且高效的算法模块,提升计算效率。(3)软件开发法:开发基于并行计算的ABEEMσπ模型能量求解程序,并集成到并行计算平台中,实现不同规模数据的并行计算测试。(4)实验分析法:对不同规模数据进行并行化计算测试,评估并行化计算方案的效率和精度,并进行对比分析。5.研究计划时间节点|研究内容-|-2022.1-2022.3|文献调研和理论分析2022.4-2022.7|算法设计和实现2022.8-2023.1|并行计算平台开发和测试2023.2-2023.5|实验分析和结果对比分析2023.6-2023.7|论文撰写和答辩准备6.研究经费本研究所需经费大约为XX万元,包括研究设备、材料费、人员工资等费用。7.研究人员阅读并熟悉相关文献,进行理论分析和编写算法的研究人员:X、X(硕士研究生);开发并行计算平台和进行实验分析的研究人员:X、X(博士研究生)。8.研究成果(1)开发基于ABEEMσπ模型能量求解并行处理的程序和计算平台,具备高效并行处理的能力;(2)研究提出一种有效的算法模块,满足对大尺寸蛋白质分子和生物大分子体系的能量求解需求;(3)在测试数据上评估计算方案的精度和效率,为分子模拟和大规模能量计算提供支持。9.研究保障本研究将得到学校(或公司)科研基金的资助和指导,同时将获得相关领域的专业人士的指导和协助。所有研究人员均有丰富的理论知识和实践经验,研究过程严格按照学术规范和科研伦理要求进行,确保研究结果可靠和有效。