传染性法氏囊病毒感染的生物标记与细胞SAGE文库的鉴定的中期报告.docx
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传染性法氏囊病毒感染的生物标记与细胞SAGE文库的鉴定的中期报告本研究旨在通过鉴定传染性法氏囊病毒(CFV)感染的生物标记和细胞SAGE文库,探究CFV感染的分子机制和细胞反应。截至中期报告,我们进行了以下工作:1.建立了CFV感染的细胞模型。我们使用EL4细胞并接种CFV,通过光镜和电镜观察到细胞内典型的法氏囊。使用蛋白质印迹和qPCR检测到CFV表面蛋白和RNA的表达,证实感染成功。2.制备了CFV感染和未感染的EL4细胞的SAGE文库。我们从感染和未感染细胞中提取总RNA,制备了SAGE文库,并通过Illumina测序得到了高质量的序列数据。经过数据清理和分析,得到了包含4万多个转录本的SAGE标签库。3.进行了差异基因分析和生物信息学分析。我们比较了CFV感染和未感染细胞的SAGE标签,筛选出了与CFV感染相关的差异基因。生物信息学分析包括GO富集分析、通路分析和蛋白互作网络分析等,初步发现了与免疫应答、细胞凋亡、转录调控等相关的通路和蛋白互作网络。未来的工作将进一步探究这些生物标记和通路的作用机制,解析CFV感染的分子机制和细胞反应。
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