酵母转录因子Cdc73的结构生物学研究的任务书.docx
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酵母转录因子Cdc73的结构生物学研究的任务书任务书任务名称:酵母转录因子Cdc73的结构生物学研究任务目的:1.理解转录调节机制的基本原理,深入探究酵母细胞中Cdc73在转录调节中的作用和机制。2.利用生物信息学方法及X射线晶体学技术,解析酵母转录因子Cdc73的结构,进一步揭示其作用机制。任务背景:Cdc73是一种关键的酵母转录因子,与TATA盒、启动子和RNA聚合酶II复合物等细胞中各种调控因素相互作用,控制基因转录调控过程中的速率和时机。Cdc73的N-和C-末端均含有结构域,参与转录调节过程的多个阶段。Cdc73与Paf1复合物、HistoneH3-lysine-4甲基转移酶和RNA聚合酶的亚单位Rpb1都存在相互关联,这种复杂的相互作用机制,是Cdc73发挥其调控作用的重要前提。任务内容:1.文献综述:调研Cdc73在酵母细胞中的结构特点、生物学功能及其调控机制。综合使用网络数据库,如PDB、GeneCards等,获取Cdc73的相关结构信息,了解其和其他蛋白质的相互作用关系。2.生物信息学分析:利用多种生物信息学工具和软件(如Swiss-Model、PyMOL、Rosetta等)对Cdc73的结构进行预测和分析,得出其三维结构模型。3.表达和纯化:基于Cdc73的序列信息,构建适合大规模生产的表达载体,并在宿主细胞(如大肠杆菌)中表达Cdc73蛋白。利用亲和层析等纯化方法纯化获得目标蛋白。4.结晶和解析:通过添加不同的化学物质和改变结晶条件等方法,筛选出最适合晶体生长的条件。通过X射线衍射技术,获取Cdc73蛋白的高分辨率晶体结构,揭示其空间构形和结构特点。5.结构解析及分析:基于已经获得的晶体结构数据,使用分子对接等技术对Cdc73和其他蛋白质的相互作用机制进行分析,探究Cdc73的功能和调控机制。任务时间:本研究的时间为6个月,具体的时间安排如下:第1-2个月:文献综述和生物信息学分析;第3-4个月:构建表达载体、表达和纯化Cdc73蛋白;第5-6个月:晶体结构研究和数据分析。任务负责人:XXX任务成员:XXX、XXX、XXX任务经费:本研究预计需要的经费为XXX元,主要用于购置试剂、培养细胞、维护设备等。具体经费分配如下:试剂:XXX元设备维护:XXX元实验室租金和设施:XXX元会议费用:XXX元任务评估:通过本次任务,需要达到如下目标:1.全面了解酵母细胞中Cdc73在转录调节中的作用和机制;2.成功获得Cdc73的晶体结构和相互作用机制,对其功能和调控机制有更为深入的理解。对于以上目标的实现情况,仪器、设备等使用情况以及任务执行时间等因素,我们将在任务执行结束后进行评估。