第二代测序数据分析原理三代DNA测序技术之比较第一代测序技术:Sanger测序法——简便、快速逐渐被遗忘得测序技术:Maxam-Gilbert得DNA化学降解法Sanger测序得局限概要第二代测序技术454SOLIDIllumina大家学习辛苦了，还是要坚持其她第二代测序技术得共同点第二代测序技术得局限第三代测序技术:单分子测序直接测序法SecondgenerationsequenceExperimentsSequencingGlossary全基因组denove分析工具分析所需工具外显子组分析工具常规分析UniGene拼接3、数据库注释UniGene表达分析UniGene表达差异分析组间差异基因上调与下调个数统计,可以通过此图观察上调与下调得一个总体趋势差异基因火山图,可以观察到差异基因总体分布GO功能分类KEGG代谢通路分析IPApathwayanalysis()COG注释SSR重复序列注释LncRNA预测RSAM‐01:模式动植物基因组数据和注释信息整合RSAM‐07:可变剪接分析RSAM‐08:转录起始位点(TSS)分析RSAM‐09、融合基因得发现(FusiongeneDiscovery)