中国汉族人白癜风易感位点的精细定位的任务书.docx
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中国汉族人白癜风易感位点的精细定位的任务书任务名称:中国汉族人白癜风易感位点的精细定位背景简介:白癜风是一种常见的色素性皮肤病,其病变表现为局部或广泛的色素缺失,给患者造成严重的身心困扰。目前认为白癜风发病的原因与遗传因素密切相关,已经发现数十个白癜风易感位点,但这些位点解释了疾病发病的一部分原因,还有大量未被阐明的遗传因素。因此,对白癜风易感位点的精细定位具有重要的临床意义和研究价值。任务目标:本任务旨在通过对中国汉族人群的基因分型,精细定位白癜风易感位点,并进一步探索其遗传机制。任务内容:1.数据来源:收集包括白癜风患者和对照组在内的中国汉族人口的基因组数据,包括GWAS、WES和WGS等,数据来源可以包括公共数据库如1000人基因组计划和自建数据库;2.数据处理:对所获得的数据进行质控、数据清洗、对SNP和INDEL进行检测和分析,确定SNP和INDEL的位点、基因、变异类型、频率等信息;3.统计分析:基于疾病和对照组的基因型数据,进行基因型和等位基因频率差异分析、基因关联、遗传模型等统计分析,筛选出与白癜风相关的易感位点;4.功能注释:对筛选出来的易感位点进行功能注释,包括位点在基因区域内的作用、影响等,并进行通路分析;5.组合分析:通过群体遗传学等方法,对筛选出来的易感位点进行组合分析,并探讨其对白癜风发病的影响。任务成果:1.精细定位中国汉族人白癜风易感位点,对其进行功能注释及通路分析,并等位基因频率差异分析、基因关联、遗传模型等方面的统计分析,筛选出与白癜风相关的位点;2.对筛选出来的白癜风易感位点进行组合分析,揭示白癜风遗传机制,为白癜风的诊断及治疗提供参考依据。3.本任务成果将被发表在高水平SCI论文上。
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