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ADF软件初学者使用指南一、安装运行ADF客户端软件用户下载ADF客户端软件,即ADF应用模型设置、前处理、结果分析软件。下载地址:中国矿业大学主页之现代分析与计算中心网站,注册后,常用下载栏目之“ADF客户端软件之windows(32-bit)”在用户的PC机的windows操作系统中安装下载的ADF客户端软件:adf2012_windows.exe安装license许可:将license.txt文件放入ADF的安装目录(ADF2012版即adf2012.01目录中)。运行ADF客户端软件:如果正常,则会出现ADF的图形界面。如果你的这台计算机没有被收录在license许可里,软件会出现如下图,请其中最后二行的内容HYPERLINK"mailto:并发送至662@163.com"并发送至662@163.com,软件管理员将回复用户一个新license文件。二、在ADF客户端软件进行前处理工作1.建立模型设置参数等,保存,会产生一个${JOBNAME}.run文件。如示例AgI_asoexcit.run2.编辑作业脚本:使用纯文本编辑软件(如记事本)编辑脚本文件,如示例adf_test.pbs。可以做一个范本,以后要计算不同的任务的时候,只需拷贝到对应目录,稍作修改即可。具体内容如下:#PBS-joe#PBS-NM3_2x12_2012#PBS-qadf#PBS-lnodes=2:ppn=12###Applyfortheuseoftwocomputenodes,eachnodeof12nuclear#PBS-Vcd$PBS_O_WORKDIR###---------------------------------------###PLEASEMODIFYYOURJOBNAME###---------------------------------------JOBNAME=AgI_asoexcit###Thenameofthejob,correspondingtothe‘*’of*.run###---------------------------------------###BEGINNINGOFEXECUTION###---------------------------------------exportADFHOME=/public/software/adf2012.01###TherootdirectoryofADFexportSCMLICENSE=$ADFHOME/license.txt###ThepathofADFlicensefileexportSCM_TMPDIR=/public/home/test/adf_tmpe###Makesureyouhaverighttowriteintothisdirectory.ADFwillgeneratescratchinthis###directory,forthisreason,you’dbettercleanthisdirectorytermly.exportADFBIN=$ADFHOME/bin###DirectoryforADFexecutablefilesexportADFRESOURCES=$ADFHOME/atomicdata###BasisfileandforcefieldfiledirectoryexportPATH=$ADFBIN:$PATH###AddadfexecutablefilederectoryintoPATHNP=`cat$PBS_NODEFILE|wc-l`###PBSfindsappropriatenodesfromnodeslisttorunthisjob/public/home/test/test/${JOBNAME}.run>${JOBNAME}.out###${JOBNAME}.runisgeneratedbyADFinput,while${JOBNAME}.outisoutputofthisjobin###textformat.logfilewillbegeneratedautomatically.Afteryousubmitthisjob,typetail–f###logfile,youcanmonitorthetask.注意:其中红色字的内容,用户自己根据自己不同的作业修改为相应的内容。建议:我校高性能计算集群用于ADF计算的刀片节点,每节点为12个计算核,用户在申请计算资源时,最好为12核或12的整数倍。并行计算并不是使用越多的核越快,对于同一类应用的作业,用户可以先依次申请6,12,24,48核计