取代法计算多肽中N-H...O=C分子内氢键键能的任务书任务：使用取代法计算多肽中N-H...O=C分子内氢键键能。步骤：1.确定多肽的序列和构象。本任务中我们使用三肽Gly-Pro-Ala，构象为全-反式构象。2.选择计算软件，建立分子模型。本任务中我们使用Gaussian09软件，建立分子模型并优化几何构型。3.确定N-H和O=C键的取代基并替换。在本任务中，我们选择用甲基基取代氢原子，得到三肽的取代结构式如下：Gly-CH3Pro-CH3Ala-CH34.用取代结构式的基团优化几何构型，并计算相应的能量。在本任务中，我们用Gaussian09计算三肽分子和取代结构式的基团的能量。5.计算氢键键能。用取代结构式的能量减去三肽分子的能量和取代基团的能量，即三肽中N-H...O=C氢键键能。6.反复优化几何构型并计算能量，以获得更精确的结果。参考步骤：1.Li,X.;Lu,L.;Fang,Y.Calculationoftheintramolecularhydrogenbondstrengthinpeptidesbythedensityfunctionaltheorymethod.J.Mol.Struct.(THEOCHEM)2004,676,119-126.2.Frenking,G.;Hogardo-Muguia,E.;Xu,R.Intramolecularhydrogenbonding:amolecularorbitalperspective.Tetrahedron1994,50,9457-9476.