栀子及其近缘类群的随机扩增多态DNA分析.docx
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栀子及其近缘类群的随机扩增多态DNA分析【摘要】目的探索栀子与其变种雀舌栀子、重瓣栀子及变型水栀子之间的亲缘关系。方法从56个随机引物中筛选出12个引物对栀子及其近缘类群进行RAPD分析,分析中的Jaccard方法计算任意两样品间的相似系数,用组内聚类方法计算得出聚类树状。结果共得到251个有效位点。聚类分析显示,栀子与重瓣栀子最先聚类,然后与水栀子聚类,最后与雀舌栀子聚类。结论重瓣栀子与栀子亲缘关系最近,雀舌栀子与栀子的亲缘关系最远。【关键词】栀子;近缘类群;随机扩增多态DNARAPDAnalysisforGardeniajasminoidesandRelativesAbstract:ObjectiveToproberelativerelationshipamongGardeniajasminoides,itsvarietasanditsforma.MethodsRAPDanalysisforsamplesofGardeniajasminoidesandrelativeswereperformedby12randomprimersscreenedfrom56.ProximitymatrixwasanalyzedbySPSSversionandrescaleddistanceclustercombinewasobtainedbyclusteranalysiswithingroups.ResultsAtotalof251polymorphiclociwereshowedthatGardeniajasminoideswereclusteredwithG.jasminoidesfortunianaatfirst,thenwithG.jasminoidesEllis.f.longicarpa,andwithG.jasminoidesEllis.var.radicansatsamples,GardeniajasminoideswastheclosestrelativetoG.jasminoidesfortuniana,andmostdistantrelativetoG.jasminoidesEllis.var.radicans.Keywords:Gardeniajasminoides;Relatives;RAPD栀子为常用中药,具有泻火除烦、清热利尿、凉血解毒的功效。分布在长江流域及以南地区,为酸性土壤指示植物。栀子有3变种和1变型[1~7],即栀子GardeniajasminoidesEllis.、雀舌栀子G.jasminoidesEllis.var.radicansMakino、重瓣栀子G.jasminoidesEllis.var.fortunianaHara.、大花栀子G.jasminodesvar.grandifloraNakai.、水栀子G.jasminoidesEllis.f.longicarpaetOkada.,它们在形态结构上均具有一定的差异,为了探索它们之间的亲缘关系,笔者采用随机扩增多态DNA的技术对其进行了分析。1器材仪器PTC-100TMProgrammableThermalController,高速离心机IECMicro-MBcentrifuge,DZKW-C型水浴锅,DYY-Ⅲ-5型稳压稳流电泳仪,凝胶紫外成像系统,核酸紫外定量仪GENEQUANTII。试剂Taq酶,琼脂糖,dNTP,CTAB,溴化乙锭,Tris碱,EDTA,巯基乙醇,随机引物,其余试剂为北京化工厂产的分析纯。材料栀子、雀舌栀子、重瓣栀子、水栀子的叶片均由笔者采集鉴定,用硅胶快速干燥保存,样品采取混合取样,编号见表1。2方法DNA提取和浓度测定将干叶片约mg置于mlEP管中,加入液氮约30s后用镊子碾碎成细粉,立即加入500μl2×CTAB提取缓冲液[CTAB2%,Tris-HCl(pH)100mmol·L-1,EDTA20mmol·L-1,NaClmol·L-1,巯基乙醇2%]和20μl巯基乙醇,60℃水浴保温1h后,加入氯仿-异戊醇抽提,轻颠倒混匀,10000r·min-1离心10min,吸取上清液,加入等体积CTAB沉淀缓冲液[CTAB1%,Tris-HCl(pH)50mmol·L-1,EDTA10mmol·L-1,巯基乙醇1%],室温下放置h以上,10000r·min-1离心10min,小心倾去上清液,沉淀用70%乙醇和无水乙醇各轻洗1次,弃洗液,留沉淀挥干。用20μlTE溶解备用。用%琼脂糖凝胶电泳,以λDNA作对照和用核酸紫外定量仪测定浓度相结合。表1实验材料来源、采集时间DNA浓度的选择用S267引物对DNA模板的不同浓度扩增结果比较,选择扩增效果好的浓度进行扩增。PCR扩增25μl反应体系:dNTPs10mmol·μl,引物