Gallusgallus非编码RNA的生物信息学分析的中期报告Gallusgallus非编码RNA的生物信息学分析中期报告：鸡（Gallusgallus）是重要的农业家禽之一，同时也是研究动物模型。在整个基因组序列中，非编码RNA（ncRNA）占据了重要地位，包括长非编码RNA（lncRNA）和微小RNA（miRNA）。本文旨在对鸡的ncRNA进行生物信息学分析，以了解这些ncRNA在生物过程中的作用。首先，我们使用NCBI数据库和Ensembl数据库中鸡的整个基因组序列作为参考序列，从中筛选出lncRNA。采用多种生物信息学工具，如CPC和PFAM等，对筛选出的lncRNA进行结构和功能预测。其中，CPC基于编码蛋白的特有区域，可以帮助我们区分lncRNA和蛋白编码RNA。PFAM则可以预测lncRNA中的保守结构域。通过这些分析，我们已经初步预测出了鸡的lncRNA的结构和功能。接下来，我们将着眼于miRNA。我们使用鸡的miRNA库，利用miRDeep2等生物信息学工具预测出了鸡的miRNA，并运用TargetScan和miRanda等工具预测了miRNA的RNA靶向基因。这些RNA靶向基因对我们了解miRNA在调节基因表达中的作用非常重要。未来，我们将在这些ncRNA的预测分析基础上，进一步深入研究它们在鸡的生长和发育以及疾病发生中的具体作用。