通常把鉴定微生物的技术分成四个不同水平：①细胞的形态和习性水平，例如用经典的研究方法，观察细胞的形态特征、运动性、酶反应、营养要求和生长条件等。②细胞组分水平，包括细胞组成成分例如细胞壁成分，细胞氨基酸库，脂类，醌类，光合色素等的分析，所用的技术除常规实验室技术外，还使用红外光谱、气相色谱和质谱分析等新技术。③蛋白质水平，包括氨基酸序列分析、凝胶电泳和血清学反应等若干现代技术。④基因或DNA水平，包括核酸分子杂交（DNA与DNA或DNA与RNA），G＋Cmol%值的测定，遗传信息的转化和转导，16SrRNA（核糖体RNA）寡核苷酸组分分析，以及DNA或RNA的核苷酸顺序分析等。在微生物分类学发展的早期，主要的分类鉴定指标尚停留在细胞的形态和习性水平上，这类方法可称作经典的分类鉴定方法；从本世纪60年代起，后三个水平的分类鉴定的理论和技术即化学分类学开始发展，度为探索微生物的自然分类系统打下了坚实的基础，这些方法再加上数值分类法，可称为现代的分类鉴定方法。一、经典分类鉴定方法群体：菌落形态，在半固体或液体培养基中的生长状态等形态个体：细胞形态，染色反应，各种特殊构造等营养要求：能源，碳源，氮源，生长因子等生理、生化反应酶；产酶种类和反应物性等代谢产物：种类，产量，显色反应等经典指标生态特性：生长温度，对氧的需要，宿主种类等生活史特点血清学反应噬菌体的敏感性其它经典分类法二、现代分类鉴定方法1.DNA的碱基组成(G+Cmol%)1.DNA的碱基组成(G+Cmol%)1.DNA的碱基组成(G+Cmol%)2.核酸的碱基组成和分子杂交：DNA-DNA杂交DNA—rRNA杂交3.建立16SrRNA系统发育树3、16SrRNA(16SrDNA)寡核苷酸的序列分析分离菌株16SrRNA基因比对分析比对分析（二）细胞化学成分的鉴定（二）细胞化学成分的鉴定细菌的化学组分分析及其在分类水平上的应用细胞化学成分鉴定的意义（三）数值分类法数值分类的基本步骤数值分类法数值分类法的优越性主要参考书：1.食品微生物学，贾英民主编，中国轻工业出版社。2.新编食品微生物学张文治编著，中国轻工业出版社。3.微生物学（武汉大学、复旦大学）合编，高教出版社。4.工业微生物生理与遗传育种学陶文沂主编，中国轻工业出版社。5.微生物工程工艺原理姚汝华主编，华南理工大学出版社。6.现代食品发酵技术王福源主编，中国轻工业出版社。7.微生物学教程周德庆编，高等教育出版社。8.微生物学沈萍主编，高等教育出版社。9.食品微生物学杨洁彬主编中国农业大学出版。