蛋白质序列二级结构的搜索.ppt
上传人:天马****23 上传时间:2024-09-11 格式:PPT 页数:18 大小:305KB 金币:10 举报 版权申诉
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Abstract1.Introduction1.1生物背景知识1.2科学动力1.3内容2.蛋白质格式(format)3.查询语言和例子4.查询估计技术4.1ComplexScanofProteinTable(CSP)4.2普通分区技术5.1Query优化和估计5.2复杂直方图5.2.2结果基数估计假设:segment在proteinid和startposition上均匀分布简单起见,对应于同一个proteinid结果基数=每种情况匹配数的估计结果选择=结果基数/总的蛋白质数Case1-3:结果选择=第一个桶匹配数/桶内蛋白质数*第二个桶的匹配数/桶内蛋白质数Case4-6:Np1=1/50*(numberofp1)Np2=40/50*(numberofp2)设每个桶有100个proteinid结果选择=np1*np2/1005.2.3直方图分析5.3Costformula6.实验结果7.未来的工作