2011年7月27日在深港双方的共同努力下，深圳市政府与香港大学双方签订香港大学深圳医院合作协议2011年11月14日香港大学深圳医院董事会召开第一次会议，审议并通过了医院董事会章程。2012年7月1日经过充分沟通和紧张筹备，2012年7月1日，香港大学深圳医院如期试业。医院概况全力推进深港合作和医改工作推行政事分开、管办分离，建立法人治理结构董事会、监事会和医院管理团队“决策、执行、监督”三权分立实行董事会领导下的院长负责制，通过《医院章程》管理运作改革人事编制制度，实行员额管理广纳人才，提升本地医疗水平制订《医院财务工作指引》，实行全面预算管理，坚持公益性原则成立内审委员会，聘请外部审计机构进行审核，加强监管推行打包收费有利于抑制过度医疗，简化就医流程，提高患者满意度门诊量稳步上升（2012.7-2013.6）2012年成为香港大学附属医院，将引进五大优势专科器官移植Organtransplantation肿瘤综合治疗Cancertreatment骨科与创伤OrthopaedicsandTrauma心血管治疗Cardiovasculardiseases生殖医学及产前诊断ReproductiveMedicineandprenataldiagnosis举办香港外科论坛、国际临床药师学术会等多次国际性学术会议正申请成为广东省专科医师（全科医学）培训基地及临床医师培训基地启动约5000m2的中心实验室建设，引入尖端设备和优秀人才申请国家“973计划”以及“863计划”等研究项目启动ACHS国际医疗卫生机构认证，争取于2013年取得证书。参照三级甲等医院评审标准不断规范和完善医疗服务和管理。推行政事分开、管办分离，建立法人治理结构董事会、监事会和医院管理团队“决策、执行、监督”三权分立实行董事会领导下的院长负责制，通过《医院章程》管理运作改革人事编制制度，实行员额管理