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第一节真核生物中基因表示水平分析第二节染色质水平上基因活化调整二、转录基因与核小体结构三、蛋白质修饰与基因活化调整(三)高迁移率群蛋白质五、基因丢失、重排、扩增与基因活性调整一、真核生物RNA聚合酶有三种RNA聚合酶:RNA聚合酶ⅠRNA聚合酶ⅡRNA聚合酶Ⅲ二、真核基因顺式作用元件(一)、顺式作用元件概念指DNA上对基因表示在调整活性一些特定调控序列,其活性仅影响其本身处于同一DNA分子上基因。(二)、种类开启子、增强子、静止子真核生物中基因表达水平分析专家讲座1、开启子结构和功效(1)TATA框(TATAframe):其一致次序为TATAA(T)AA(T)。TATA框中心在-30附近,相当于原核-10序列(pribnowbox)。对大多数真核生物来说,RNA聚合酶与TATA框牢靠结合之后才能开始转录。TATA框左右富含G┇C序列,这就有利于该框与RNA聚合酶形成开放性开启子复合物。(2)CAAT框(CAATframe):位置在-75附近,一致序列为GGC(T)CAATCT。CAAT框可能控制着转录起始频率。(3)GC框在-90bp左右GGGCGG序列称为GC框。真核生物中基因表达水平分析专家讲座RNA聚合酶I转录调控区一个在-30—+15即关键开启子(corepromoterelement),另一为上游开启子区(upstreampromoterelement)在-150—-50,不一样物种开启子因子有显著差异,开启子区没有和mRNATATA和CAAT盒次序,故物种间大前体-rRNA基因转录起始是不一样。基因间间隔含一个或几个终止信号可终止其之前基因转录而其本身不转录,间隔区含各种反向次序可作为增强子结合转录因子。增强子(enhancer):又称为远上游序列(farupstreamsequence)。它是远距离调整开启子以增加转录速率DNA序列,其增强作用与序列方向无关,与它在基因上下游位置无关。增强子有强烈细胞类型选择,即不一样细胞类型,增强作用不一样。(1)它能经过开启子大幅度地增加同一条DNA链上靶基因转录频率,普通能增加10~200倍,有甚至可达千倍。(2)增强子作用对同源或异源基因一样有效,如把SV40增强子连接到兔β-珠蛋白基因上,可使转录强度增大100倍;(3)增强子位置可在基因5′上游、基因内或其3′下游序列中,而其作用与所在基因旁侧部位方向似无关系,因为不论正向还是反向,它都含有增强效应;(4)增强子所含核苷酸序列大多为重复序列,其内部含有关键序列,对于它进入到另一宿主之后重新产生增强子效应至关主要;(5)增强子普通都含有组织和细胞特异性;(6)增强子在DNA双链中没有5′与3′固定方向性;(7)增强子可远离转录起始点,通常在1~4kb(个别情况可达30kb)外起作用;(8)增强子活性与其在DNA双螺旋结构中空间方向性相关。另外,许多增强子还受到外部信号调控,如金属硫蛋白基因增强子就可对环境中锌、镉浓度作出反应。3、静止子类似增强子但起负调控作用顺式元件。静止子与反式作用因子(蛋白质)结合后,使正调控系统失去作用。三、转录起始调整真核生物中基因表达水平分析专家讲座类型II基因转录因子普遍性转录因子:作用于基本关键开启子如TATAbox、INR(转录起始区),每种细胞类型都必需,如TFIID/A/B/E/F/G/H/I等。特异性转录因子:作用于转录起始复合物形成过程靶分子和控制位点,含DNA特异性序列结合结构域和激活结构域(有二者都有)。普遍性转录因子结构与功效TFIIDTBP(TATAbindingprotein)结构域结合开启子TATAbox,促进其它转录因子结合。TFIII结合INR。许多普遍性转录因子含有与RNA聚合酶因子相同结构域,识别特异开启子起始转录。RNApol.II结构与功效:CTD结构域含YSPTSPS重复单位,不一样物种重复数不一样,CTD对转录活性是必需,其Ser/Thr能够被不一样程度磷酸化在转录起始与延伸中含有主要作用。例:RNA聚合酶Ⅱ转录起始复合物组装第一步是转录因子TFⅡD与TATA框特异性结合,形成TFⅡD-开启子复合体,后者进而指导聚合酶Ⅱ和其它基本转录因子与开启子进行有序装配,最终形成一个稳定起始复合物。真核生物中基因表达水平分析专家讲座四、调控转录反式作用因子能识别或结合在顺式作用元件关键序列上参加调控靶基因转录效率结合蛋白,称为反式作用因子。(一)反式作用因子结构特征1、DNA识别或DNA结合结构域2、激活基因转录功效结构域3、结合其它蛋白或调控蛋白调整结构域(二)序列特异性DNA结合蛋白几个结构域1.螺旋-转角-螺旋结构螺旋-转角-螺旋(helix-turn-helix)2.锌指结构锌指