生命情报学特论.ppt
上传人:天马****23 上传时间:2024-09-11 格式:PPT 页数:31 大小:1.6MB 金币:10 举报 版权申诉
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RNA二次構造予測RNA二次構造予測RNA二次構造の二種類の表現RNA二次構造の例Nussinovアルゴリズム予測アルゴリズム(Nussinovアルゴリズム)アルゴリズムの説明Nussinovアルゴリズムの解析RNA二次構造予測と確率文脈自由文法RNA二次構造予測と確率文脈自由文法(1)RNA二次構造予測と確率文脈自由文法(2)Valiantアルゴリズムの利用二次構造予測の計算量の改良Valiantアルゴリズムの概略(1)Valiantアルゴリズムの概略(2)Valiantアルゴリズムの概略(3)メインルーチン:下図のとおり時間計算量:まとめRNA二次構造予測のO(n2.8…polylog(n))時間アルゴリズム背景アルゴリズムの概略Phase2:解析Phase3:正当性時間計算量の解析補題3:証明(1)補題3:証明(2)まとめ