一、酶的分子组成辅助因子分类（按其与酶蛋白结合的紧密程度）酶按结构分类多酶体系(multienzymesystem)：由几种不同功能的酶彼此聚合形成的多酶复合物共同完成催化功能的多酶复合物。多功能酶(multifunctionalenzyme)或串联酶(tandemenzyme)：多种不同催化功能存在于一条多肽链中，这类酶称为多功能酶。某些必需基团在一级结构上可能相距得很远，但在空间结构上彼此靠近，组成具有特定空间结构的区域，它能与底物结合，并催化底物生成产物，称这个区域为酶的活性中心(activecenter)酶的活性中心活性中心内的必需基团溶菌酶的活性中心常见的必需基团有：组氨酸的咪唑基，丝氨酸的羟基，半胱氨酸的巯基，酸性氨基酸的羧基，碱性氨基酸的氨基。三、酶的辅因子与功能金属酶(metalloenzyme)金属离子与酶结合紧密，提取过程中不易丢失。金属激活酶(metal-activatedenzyme)金属离子为酶的活性所必需，但与酶的结合不甚紧密。维生素与辅助因子四、酶的结构与功能胰蛋白酶的口袋较深，底部含带负电的Asp189，可容纳底物的带正电的长侧链Arg或Lys，使Arg或Lys的羧基端肽键被水解。胰凝乳蛋白酶的口袋较宽，并由非极性氨基酸残基构成，故可容纳大侧链疏水的芳香族氨基酸，使其羧基端肽键被水解。弹性蛋白酶的袋口两侧为Val，对大或长侧链残基的进入有阻碍作用，故该酶易水解小侧链的非极性氨基酸的羧基端肽键－Ala。酶原的激活酶原激活的原理赖酶原激活的生理意义TherecognitionofalysosomalhydrolaseinGolgiandmannosephosphorylation第三节酶的作用机理（一）高效性二、中间复合物学说在酶催化的反应中，第一步是酶与底物形成酶－底物中间复合物。当底物分子在酶作用下发生化学变化后，中间复合物再分解成产物和酶。E+S====E-SP+E许多实验事实证明了E－S复合物的存在。E－S复合物形成的速率与酶和底物的性质有关。（一）趋近和定向效应：底物结合在酶的活性中心，形成利于反应的正确定向关系趋近：局部范围内底物浓度增加；定向：反应物以正确的方式碰撞；靠近（二）底物变形与张力作用：酶与底物结合后，使底物的某些敏感键发生变形，从而使底物分子接近于过渡态，降低了反应的活化能。（三）共价催化作用：某些酶与底物结合形成一个反应活性很高的共价中间产物，这个中间产物以较大的概率，转变为过渡状态，因此反应的活化能大大降低，底物可以越过较低的能阈而形成产物。酶分子上的亲核基团有Ser-OH、Cys-SH、His-咪唑基等，这些富含电子的基团(有孤对电子)，攻击底物分子中电子云密度较小的亲电子基团，并供出电子，二者形成共价键，酶和底物形成一个不稳定的中间物，进而转变为产物。咪唑催化乙酸硝基苯酯水解反应（四）酸碱催化作用：广义的酸碱催化：是指质子供体和质子受体的催化。很多酶活性中心存在酸性或碱性氨基酸残基，例如羧基、氨基、胍基、巯基、酚羟基和咪唑基等，它们在近中性pH范围内，可作为催化性质的质子受体或质子供体，有效地进行酸碱催化。影响因素：酸碱的强度供出或接受质子的速度His残基的咪唑基是酶的酸碱催化作用中最活泼的一个催化功能团