HPC用户环境设置.ppt
上传人:天马****23 上传时间:2024-09-11 格式:PPT 页数:22 大小:278KB 金币:10 举报 版权申诉
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!!!声明!!!用户环境设置方式用户环境变量用户环境变量(续)用户环境变量(续)使用EnvironmentModulesEnvironmentModules注意事项用户环境设置注意事项用户环境设置注意事项(续)loginshell与nonlogin-shellInteractive与non-interactiveshells用户环境初始化流程用户环境初始化流程(续)不同Shell模式都涉及的用户初始化文件运行MPI任务时环境初始化过程运行MPI任务时环境初始化过程(续)作业脚本的额外设置把当前脚本中用户环境变量复制到作业脚本运行环境中在PBS作业脚本中设置#PBS–V#!/bin/bashexportwork_dir=/blah/blahexportdata_dir=/blah/blah……qsubmy_job.sh...…快速检测运行环境软件环境的检测#!/bin/bash##PBS-Ncheck_env#PBS-qRegular#PBS-lnode=2:ppn=2#PBS-lwalltime=00:00:10#PBS-PP000000000#cd$PBS_O_WORKDIRpwd>env_pwd_outmodulelist>env_module_out2>&1env>env_outulimit-a>env_ulimit_outecho$PATH>env_PATH_outecho$LD_LIBRARY_PATH>env_LD_LIBRARY_PATH_outwhichmpirun>env_which_mpimpicc-v>>env_which_mpi2>&1mpif90-v>>env_which_mpi2>&1#!/bin/bash##PBS-Nhello#PBS-qRegular#PBS-lnode=2:ppn=2#PBS-lwalltime=00:00:10#PBS-PP000000000cd$PBS_O_WORKDIRmpirun-np4./hello问题或建议