分子生物学基因组与比较基因组学2.基因组的种类与结构特点2.基因组的种类与结构特点（2）大小基因组大小（genomesize）一般以单倍体基因组的核酸量来衡量，单位有pg（10-12g）、Dalton（道尔顿）、bp或kb、Mb等1pg=6.02x1011Daltons=9.8x108bp生物的复杂程度与基因组大小的关系C值佯谬（C-ValueParadox）（3）类核基因组和核基因组的结构特点类核基因组环状；基因排列紧密，较少非编码序列：“streamlined”核基因组多线状；大小变化范围很大；有大量的非编码序列（重复序列、内含子等）（4）非编码序列（non-codingsequences）非编码的重复序列（核基因组）(a)局部分布的重复序列（localizedrepeatedsequences）串联式（tandem）的高度重复序列（highlyrepeatedsequences）(b)散布的重复序列（dispersedrepeatedsequences）短的散布式重复序列（shortinterspersedelements,SINEs）长的散布式重复序列（longinterspersedelements,LINEs）内含子（intron）I类（groupIintron）II类（groupIIintron）III类（groupIIIintron）核mRNA内含子（nuclearmRNAintron），即剪接体内含子（spliceosomalintron）核tRNA内含子（nucleartRNAintron）古细菌内含子（archaebacterialintron）（5）细胞器基因组线粒体基因组在不同类型的生物（多细胞动物、高等植物、原生动物、藻类、真菌）中变化很大多细胞动物：细小、致密高等植物：复杂、不均一原生动物、藻类、真菌：或偏向于动物型，或偏向于植物型，但又有其各自的独特之处2.基因组的种类与结构特点3.基因组学（Genomics）3.基因组学PhageX174:5375nt结构基因组学的成就大大促进了生物信息学（bioinformatics）的发展（3）类核基因组和核基因组的结构特点内含子（intron）人类基因组计划（theHumanGenomeProject）之前，只测定过1996古细菌Methanococcusjannaschii1,660kb或偏向于植物型，但又有其各自的独特之处对基因组中基因本身的认识（基因的概念）果蝇1个基因/13kb2000拟南芥（Arabidopsisthaliana）120,000kb（4）非编码序列（non-codingsequences）拟南芥1个基因/5kb蛋白标记最原始的基因和基因组的起源，其后的进化模式与过程串联式（tandem）的高度重复序列（highlyrepeatedsequences）第二代短串联重复序列（shorttandomrepeat,结构基因组学研究的主要目标（3）类核基因组和核基因组的结构特点2000黑腹果蝇（Drosophilamelanogaster）180,000kb人类基因组计划遗传图物理图序列图转录图在整个人类基因组中，只有1%～5%的DNA序列为编码序列。（3）类核基因组和核基因组的结构特点02x1011Daltons=9.第二代短串联重复序列（shorttandomrepeat,基因组的种类与结构特点基因组结构（genomestructure）“一种（或一个）细胞内存在的全部蛋白质通过比较，发现基因组中蛋白质和功能RNA基因的密度与生物的复杂程度有一定的负相关在不同类型的生物（多细胞动物、高等植物、原生动物、藻类、真菌）中变化很大蛋白质组学（proteomics）生物体单倍体基因组所含DNA总量称为C值（3）类核基因组和核基因组的结构特点大规模、高通量分析基因组中基因表达的技术基因组的种类与结构特点（包括修饰后的各种蛋白质）”比较均一，85~292kb类核基因组（nucleoidgenome）结构基因组学的成就大大促进了生物信息学（bioinformatics）的发展（2）功能基因组学（functionalgenomics）大规模、高通量分析基因组中基因表达的技术DNA芯片（DNAchip），即DNA微阵列（DNAmicroarray）基因功能的分析基因剔除（geneknockout）对基因组中基因本身的认识（基因的概念）编码蛋白质的基因编码功能RNA的基因非编码的DNA也可以是基因？DNAmicroarray（3）进化基因组学（evolutionarygenomics）不同生物基因组中