实习4-蛋白质结构与功能预测.ppt
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234蛋白质结构预测过程678工具101112131415(a)-TypeImembraneprotein(b)-TypeIImembraneprotein(c)-Multipasstransmembraneproteins(d)-Lipidchain-anchoredmembraneproteins(e)-GPI-anchoredmembraneproteins典型的跨膜螺旋区主要是由20~30个疏水性氨基酸(Leu、Ile、Val、Met、Gly、Ala等)组成;亲水残基往往出现在疏水残基之间,对功能有重要的作用;基于亲/疏水量和蛋白质跨膜区每个氨基酸的统计学分布偏好性。跨膜蛋白序列“边界”原则192021222324262728工具30如何使用PredictProteinPredictProtein提交界面3435PredictProtein分析结果详解ProSite模体搜索结果PHD跨膜螺旋区预测结果PROF二级结构预测结果4041基本类型:4344InterPro数据库简介InterPro数据库47InterProScan工具结果反馈5051InterPro蛋白家族信息InterPro蛋白家族信息(续)InterPro蛋白家族信息(续)5556575859606162串线法6466676869707172PDB格式文件简介(续)PDB格式文件举例75SWISS-PdbViewer主要功能77回到原始构象8081