qPCR流程图.doc
上传人:天马****23 上传时间:2024-09-15 格式:DOC 页数:4 大小:196KB 金币:10 举报 版权申诉
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.精选范本一、TotalRNA的提取:取出样本,放入灭过菌的研钵中,倒入液氮,研磨,整个过程要始终保持有液氮,15min左右,研磨充分后加入1.5ml的EP管,加入1mlTrizol,充分匀浆。(另一种,加入trizol会冻起来,就一直研磨,直到最后化成液体。)室温静置10min,12000g,4度,5min,上清转移到新的1.5ml的EP管中加入1/4体积的氯仿,振荡混匀,室温静置15min,12000g,4度,15min,上清转移至新管;加入等体积的异丙醇,轻轻摇匀,室温静置10min,12000g,4度,10min弃上清,留沉淀,加入1ml的75%乙醇清洗沉淀,7500g,4度,5min,弃上清保留沉淀。重复三次弃上清留沉淀,自然风干(5~10min),加入32ulDEPC处理过的水,测OD260/280的值,根据结果调整至1μg/μl=1000ng/μl,立即进行反转录,剩余的RNA标好号存放在-80℃下。附:1OD260=40μg/ml用样本跑电泳,确定RNA的完整性,注意在这之前把胶配好。(可无)可见明显的两条带,并且28S是18S亮度的两倍,还有下边一条不太明显的5SRNA的条带。证明RNA完整无降解。二、反转录:说明书:10μl反应体系可最大使用500ng的TotalRNA。20/1μg(以前用的40,下次用20)20ul的体系:先把buffer和RNaseFreedH20和enzyme配成mix5×PrimeScriptBuffer(forRealTime):4μlPrimeScriptRTEnzymeMixI:1μlOligodTPrimer(50μM):1μlRandom6mers(100μM):1μl总RNA:1μl(1μg/μl)RNaseFreedH2O:12μl反转录反应条件如下:37℃15min(反转录反应)85℃5sec(反转录酶的失活反应)4℃-20℃分装保存(尽量不要反复冻融,avoidfreeze-thawcycles)三、内参检测β-actin50µl体系试剂使用量10*taqbuffer5µldNTP4µlPrimer-F(100µM)0.5µlPrimer-R(100µM)0.5µlTaqE0.25µl模板<500ng1µl灭菌蒸馏水加至50µlPCR反应条件:扩增1kb的DNA片段的PCR反应条件如下:预变性:95℃,3min98℃10sec.55℃30sec.(下次60℃,去掉非特异性)72℃30s(对于80bp的内参来说是不是可以省去)72℃5min.4℃保存电泳:2%琼脂糖凝胶,125V,15min,注意换成20bp的marker,不要加太多。四、定量PCR电泳检测,条件同上。增大至50个循环。五、分析数据引物AT1F:GCCCTTCGGCAATCACCTATAT1R:TGAGACACGTGAGCAGGAACAT2F:CCTGGCAAGCATCTTATGTAGTTCAT2R:CCGGAAATAAAATGTTGGCAATACTINFGCAGATGTGGATCAGCAAGCRGGCGGACTGTTACTGAGCT